Professeur Layton et l'étrange enquête est un manga basé sur la série Professeur Layton, et a été écrit par Sakura Naoki. L'histoire est racontée par Luke.
Les histoires dans les livres sont plus axés sur le comique que sur les mystères et la résolution de puzzles. Le professeur Layton et Luke ont des personnalités très différentes. Le livre inclut cependant quelques énigmes, qui peuvent être résolues par le lecteur si désiré.